Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eP22646 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms