Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RarbP22605 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RarbP22605 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RarbP22605 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RarbP22605 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RarbP22605 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RarbP22605 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RarbP22605 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RarbP22605 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RarbP22605 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RarbP22605 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RarbP22605 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RarbP22605 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RarbP22605 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RarbP22605 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RarbP22605 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RarbP22605 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RarbP22605 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RarbP22605 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RarbP22605 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RarbP22605 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RarbP22605 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RarbP22605 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RarbP22605 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RarbP22605 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RarbP22605 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RarbP22605 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RarbP22605 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RarbP22605 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RarbP22605 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RarbP22605 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RarbP22605 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RarbP22605 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RarbP22605 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RarbP22605 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RarbP22605 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RarbP22605 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RarbP22605 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RarbP22605 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RarbP22605 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RarbP22605 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RarbP22605 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RarbP22605 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RarbP22605 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RarbP22605 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RarbP22605 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RarbP22605 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RarbP22605 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RarbP22605 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RarbP22605 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RarbP22605 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RarbP22605 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RarbP22605 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RarbP22605 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RarbP22605 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RarbP22605 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RarbP22605 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RarbP22605 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RarbP22605 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RarbP22605 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RarbP22605 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RarbP22605 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RarbP22605 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RarbP22605 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RarbP22605 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RarbP22605 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RarbP22605 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RarbP22605 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RarbP22605 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RarbP22605 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RarbP22605 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RarbP22605 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RarbP22605 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RarbP22605 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RarbP22605 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RarbP22605 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RarbP22605 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RarbP22605 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RarbP22605 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RarbP22605 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RarbP22605 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RarbP22605 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RarbP22605 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RarbP22605 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms