Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klra1P20937 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klra1P20937 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klra1P20937 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klra1P20937 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klra1P20937 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klra1P20937 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klra1P20937 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms