Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxb9P20615 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxb9P20615 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms