Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntf3P20181 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms