Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms