Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18533 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18533 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18533 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18533 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P18533 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P18533 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18533 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18533 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18533 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18533 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18533 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18533 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18533 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18533 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18533 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18533 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P18533 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P18533 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18533 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18533 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P18533 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18533 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18533 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18533 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18533 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P18533 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18533 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18533 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18533 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18533 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18533 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18533 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P18533 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18533 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18533 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18533 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18533 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18533 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18533 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18533 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18533 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P18533 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18533 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18533 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18533 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18533 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18533 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18533 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18533 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18533 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P18533 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms