Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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