Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SptbP15508 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SptbP15508 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SptbP15508 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SptbP15508 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SptbP15508 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SptbP15508 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SptbP15508 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SptbP15508 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SptbP15508 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SptbP15508 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SptbP15508 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SptbP15508 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SptbP15508 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SptbP15508 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SptbP15508 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SptbP15508 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SptbP15508 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SptbP15508 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SptbP15508 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SptbP15508 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SptbP15508 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SptbP15508 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SptbP15508 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SptbP15508 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SptbP15508 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SptbP15508 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SptbP15508 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SptbP15508 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SptbP15508 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SptbP15508 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SptbP15508 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SptbP15508 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SptbP15508 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SptbP15508 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SptbP15508 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SptbP15508 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SptbP15508 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SptbP15508 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SptbP15508 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SptbP15508 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SptbP15508 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SptbP15508 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SptbP15508 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SptbP15508 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SptbP15508 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SptbP15508 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SptbP15508 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SptbP15508 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SptbP15508 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SptbP15508 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SptbP15508 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SptbP15508 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SptbP15508 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SptbP15508 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SptbP15508 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SptbP15508 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SptbP15508 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SptbP15508 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SptbP15508 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SptbP15508 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SptbP15508 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SptbP15508 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SptbP15508 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SptbP15508 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SptbP15508 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SptbP15508 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SptbP15508 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SptbP15508 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SptbP15508 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SptbP15508 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SptbP15508 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SptbP15508 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SptbP15508 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SptbP15508 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SptbP15508 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SptbP15508 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SptbP15508 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SptbP15508 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SptbP15508 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SptbP15508 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms