Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dnmt1P13864 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnmt1P13864 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms