Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp1P12032 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp1P12032 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp1P12032 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp1P12032 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Timp1P12032 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp1P12032 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp1P12032 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp1P12032 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp1P12032 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp1P12032 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp1P12032 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp1P12032 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp1P12032 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp1P12032 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timp1P12032 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timp1P12032 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms