Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DmdP11531 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DmdP11531 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DmdP11531 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DmdP11531 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DmdP11531 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DmdP11531 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DmdP11531 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DmdP11531 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DmdP11531 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DmdP11531 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DmdP11531 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DmdP11531 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DmdP11531 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DmdP11531 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DmdP11531 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DmdP11531 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DmdP11531 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DmdP11531 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DmdP11531 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DmdP11531 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DmdP11531 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DmdP11531 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DmdP11531 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DmdP11531 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DmdP11531 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DmdP11531 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DmdP11531 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DmdP11531 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DmdP11531 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DmdP11531 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DmdP11531 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DmdP11531 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DmdP11531 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DmdP11531 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DmdP11531 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DmdP11531 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DmdP11531 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DmdP11531 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DmdP11531 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DmdP11531 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DmdP11531 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DmdP11531 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DmdP11531 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DmdP11531 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DmdP11531 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DmdP11531 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DmdP11531 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DmdP11531 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DmdP11531 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DmdP11531 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DmdP11531 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DmdP11531 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DmdP11531 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DmdP11531 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DmdP11531 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DmdP11531 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DmdP11531 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DmdP11531 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DmdP11531 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DmdP11531 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DmdP11531 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DmdP11531 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DmdP11531 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DmdP11531 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DmdP11531 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DmdP11531 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DmdP11531 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DmdP11531 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DmdP11531 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms