Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms