Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PolP11369 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PolP11369 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PolP11369 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PolP11369 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PolP11369 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolP11369 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolP11369 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolP11369 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolP11369 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolP11369 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolP11369 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PolP11369 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PolP11369 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolP11369 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolP11369 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolP11369 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolP11369 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolP11369 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolP11369 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolP11369 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolP11369 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolP11369 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolP11369 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolP11369 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PolP11369 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolP11369 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolP11369 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolP11369 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolP11369 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolP11369 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolP11369 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolP11369 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolP11369 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PolP11369 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolP11369 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolP11369 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolP11369 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolP11369 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PolP11369 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolP11369 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PolP11369 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolP11369 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PolP11369 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolP11369 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PolP11369 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolP11369 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolP11369 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolP11369 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolP11369 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolP11369 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolP11369 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolP11369 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolP11369 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolP11369 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolP11369 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolP11369 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PolP11369 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PolP11369 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PolP11369 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PolP11369 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PolP11369 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PolP11369 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PolP11369 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms