Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FlgP11088 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FlgP11088 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FlgP11088 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FlgP11088 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FlgP11088 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FlgP11088 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FlgP11088 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FlgP11088 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FlgP11088 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FlgP11088 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FlgP11088 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FlgP11088 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FlgP11088 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FlgP11088 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FlgP11088 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FlgP11088 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FlgP11088 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FlgP11088 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FlgP11088 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FlgP11088 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FlgP11088 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FlgP11088 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FlgP11088 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FlgP11088 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FlgP11088 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FlgP11088 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FlgP11088 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms