Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl3P10855 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl3P10855 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl3P10855 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl3P10855 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl3P10855 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl3P10855 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl3P10855 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl3P10855 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl3P10855 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms