Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd4P10628 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms