Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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