Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6c1P0CW02 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.7 ms