Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb2P0C1T1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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