Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxc9P09633 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc9P09633 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc9P09633 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms