Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtaP09225 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtaP09225 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtaP09225 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtaP09225 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtaP09225 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtaP09225 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
LtaP09225 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtaP09225 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtaP09225 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtaP09225 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtaP09225 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtaP09225 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtaP09225 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtaP09225 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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