Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SparcP07214 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SparcP07214 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SparcP07214 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SparcP07214 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SparcP07214 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SparcP07214 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SparcP07214 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SparcP07214 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SparcP07214 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SparcP07214 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SparcP07214 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SparcP07214 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SparcP07214 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SparcP07214 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SparcP07214 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SparcP07214 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SparcP07214 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SparcP07214 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SparcP07214 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SparcP07214 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SparcP07214 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SparcP07214 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SparcP07214 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SparcP07214 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SparcP07214 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SparcP07214 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SparcP07214 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SparcP07214 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SparcP07214 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SparcP07214 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SparcP07214 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SparcP07214 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SparcP07214 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SparcP07214 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SparcP07214 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SparcP07214 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SparcP07214 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SparcP07214 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SparcP07214 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SparcP07214 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SparcP07214 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SparcP07214 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SparcP07214 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SparcP07214 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SparcP07214 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SparcP07214 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SparcP07214 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SparcP07214 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SparcP07214 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SparcP07214 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SparcP07214 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SparcP07214 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SparcP07214 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SparcP07214 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SparcP07214 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms