Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa4P06798 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa4P06798 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms