Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06321 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06321 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06321 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06321 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06321 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06321 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06321 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06321 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06321 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06321 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06321 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06321 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06321 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06321 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06321 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06321 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06321 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06321 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06321 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06321 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06321 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06321 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms