Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hbb-bh1P04444 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh1P04444 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh1P04444 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh1P04444 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh1P04444 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh1P04444 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hbb-bh1P04444 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms