Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04224 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
P04224 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04224 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04224 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04224 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04224 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04224 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04224 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P04224 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04224 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04224 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04224 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04224 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04224 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04224 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04224 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04224 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04224 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04224 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04224 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04224 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P04224 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04224 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04224 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04224 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04224 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04224 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04224 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04224 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04224 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04224 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms