Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt1P04104 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt1P04104 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt1P04104 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt1P04104 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms