Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtnd1P03888 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mtnd1P03888 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms