Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01798 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01798 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01798 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01798 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01798 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01798 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01798 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01798 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01798 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01798 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01798 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01798 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01798 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01798 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01798 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01798 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01798 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01798 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms