Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01672 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01672 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01672 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01672 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01672 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01672 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01672 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01672 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01672 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01672 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01672 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01672 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01672 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01672 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01672 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01672 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01672 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01672 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01672 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01672 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01672 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01672 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01672 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01672 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01672 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01672 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01672 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01672 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01672 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01672 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01672 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01672 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01672 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01672 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01672 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01672 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01672 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01672 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01672 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01672 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01672 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01672 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01672 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01672 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01672 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01672 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01672 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01672 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01672 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01672 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01672 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01672 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01672 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01672 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01672 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01672 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01672 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01672 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01672 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01672 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01672 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01672 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01672 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01672 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01672 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01672 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms