Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01641 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01641 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01641 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01641 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01641 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01641 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01641 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01641 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01641 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01641 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01641 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01641 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01641 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01641 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01641 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01641 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01641 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01641 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01641 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01641 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
P01641 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01641 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01641 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01641 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01641 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01641 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01641 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01641 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01641 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01641 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01641 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01641 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01641 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01641 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01641 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01641 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01641 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01641 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01641 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01641 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01641 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01641 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01641 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01641 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01641 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01641 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01641 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01641 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01641 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01641 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01641 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01641 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01641 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01641 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01641 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01641 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01641 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01641 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01641 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01641 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01641 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01641 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms