Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01636 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01636 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01636 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01636 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01636 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01636 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01636 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01636 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01636 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01636 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01636 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01636 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01636 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01636 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01636 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01636 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01636 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01636 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01636 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01636 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01636 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01636 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01636 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01636 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01636 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01636 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01636 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01636 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01636 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01636 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01636 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01636 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01636 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01636 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01636 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01636 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01636 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01636 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01636 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01636 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01636 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01636 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01636 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01636 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01636 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01636 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01636 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01636 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms