Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setdb1O88974 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setdb1O88974 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms