Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MscO88940 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MscO88940 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MscO88940 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
MscO88940 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MscO88940 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MscO88940 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MscO88940 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MscO88940 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MscO88940 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MscO88940 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MscO88940 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MscO88940 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MscO88940 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MscO88940 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MscO88940 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MscO88940 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MscO88940 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MscO88940 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MscO88940 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MscO88940 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MscO88940 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MscO88940 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MscO88940 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MscO88940 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MscO88940 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MscO88940 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MscO88940 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MscO88940 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MscO88940 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MscO88940 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms