Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CcnkO88874 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CcnkO88874 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CcnkO88874 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CcnkO88874 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CcnkO88874 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CcnkO88874 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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