Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1O88746 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1O88746 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1O88746 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tom1O88746 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1O88746 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1O88746 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1O88746 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tom1O88746 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tom1O88746 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms