Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms