Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng2O88602 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng2O88602 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms