Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops6O88545 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops6O88545 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops6O88545 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops6O88545 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops6O88545 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cops6O88545 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops6O88545 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cops6O88545 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms