Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops3O88543 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops3O88543 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cops3O88543 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops3O88543 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops3O88543 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms