Protein–RNA interactions for Protein: O88466

Znf106, Zinc finger protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf106O88466 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf106O88466 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf106O88466 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf106O88466 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf106O88466 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf106O88466 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms