Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtssO70370 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtssO70370 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtssO70370 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtssO70370 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtssO70370 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtssO70370 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtssO70370 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtssO70370 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtssO70370 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtssO70370 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtssO70370 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtssO70370 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtssO70370 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtssO70370 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtssO70370 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtssO70370 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtssO70370 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtssO70370 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtssO70370 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtssO70370 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtssO70370 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtssO70370 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtssO70370 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CtssO70370 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtssO70370 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtssO70370 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms