Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms