Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb2O55203 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms