Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx4O55187 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cbx4O55187 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 444.4 ms