Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp2a2O55143 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp2a2O55143 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms