Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap2O55126 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap2O55126 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms