Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nipsnap1O55125 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms