Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrxO55103 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrxO55103 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrxO55103 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrxO55103 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrxO55103 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrxO55103 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrxO55103 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PrxO55103 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PrxO55103 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PrxO55103 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PrxO55103 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrxO55103 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrxO55103 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrxO55103 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrxO55103 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrxO55103 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrxO55103 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrxO55103 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrxO55103 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrxO55103 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrxO55103 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrxO55103 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrxO55103 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrxO55103 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrxO55103 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrxO55103 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrxO55103 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrxO55103 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrxO55103 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrxO55103 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrxO55103 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrxO55103 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrxO55103 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrxO55103 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PrxO55103 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PrxO55103 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrxO55103 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrxO55103 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrxO55103 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrxO55103 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PrxO55103 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrxO55103 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrxO55103 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrxO55103 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrxO55103 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrxO55103 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrxO55103 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrxO55103 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrxO55103 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrxO55103 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrxO55103 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrxO55103 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PrxO55103 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrxO55103 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrxO55103 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrxO55103 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrxO55103 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrxO55103 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrxO55103 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrxO55103 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrxO55103 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrxO55103 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrxO55103 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PrxO55103 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrxO55103 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrxO55103 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrxO55103 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrxO55103 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrxO55103 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrxO55103 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrxO55103 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrxO55103 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PrxO55103 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrxO55103 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrxO55103 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrxO55103 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrxO55103 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrxO55103 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrxO55103 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrxO55103 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrxO55103 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrxO55103 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrxO55103 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrxO55103 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms